Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH67

Xkr4, XK-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr4Q5GH67 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xkr4Q5GH67 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Xkr4Q5GH67 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xkr4Q5GH67 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms