Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc8bQ5DU41 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc8bQ5DU41 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms