Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chsy3Q5DTK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy3Q5DTK1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy3Q5DTK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms