Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Eme2Q56A04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eme2Q56A04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Eme2Q56A04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eme2Q56A04 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms