Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CenpjQ569L8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CenpjQ569L8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CenpjQ569L8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CenpjQ569L8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms