Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdp2Q504M2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdp2Q504M2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdp2Q504M2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms