Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc84Q4VA36 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc84Q4VA36 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc84Q4VA36 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms