Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rhox3aQ4TU90 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox3aQ4TU90 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox3aQ4TU90 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms