Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snhg11Q4G0K9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snhg11Q4G0K9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snhg11Q4G0K9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Snhg11Q4G0K9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Snhg11Q4G0K9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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