Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5935Q497S0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5935Q497S0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5935Q497S0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms