Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Samd5Q3V1H9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samd5Q3V1H9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Samd5Q3V1H9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms