Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc185Q3V118 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc185Q3V118 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc185Q3V118 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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