Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrfip1Q3UZ39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrfip1Q3UZ39 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms