Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc160Q3UYG1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc160Q3UYG1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms