Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc55Q3UY51 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc55Q3UY51 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc55Q3UY51 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms