Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nr1d1Q3UV55 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nr1d1Q3UV55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1d1Q3UV55 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms