Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms