Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cracr2aQ3UP38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cracr2aQ3UP38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cracr2aQ3UP38 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cracr2aQ3UP38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1136.5 ms