Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc4Q3UP24 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrc4Q3UP24 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrc4Q3UP24 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms