Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln5Q3UMW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln5Q3UMW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cln5Q3UMW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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