Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BtrcQ3ULA2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BtrcQ3ULA2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BtrcQ3ULA2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms