Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3UJC8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3UJC8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3UJC8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3UJC8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3UJC8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q3UJC8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3UJC8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q3UJC8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q3UJC8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q3UJC8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3UJC8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms