Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atxn7l3bQ3UD01 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms