Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem109Q3UBX0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem109Q3UBX0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms