Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U6N9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U6N9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Q3U6N9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U6N9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U6N9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U6N9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3U6N9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3U6N9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U6N9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U6N9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3U6N9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U6N9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms