Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gse1Q3U3C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gse1Q3U3C9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gse1Q3U3C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gse1Q3U3C9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms