Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Serac1Q3U213 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Serac1Q3U213 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms