Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J4

Ddb1, DNA damage-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb1Q3U1J4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddb1Q3U1J4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ddb1Q3U1J4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ddb1Q3U1J4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddb1Q3U1J4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddb1Q3U1J4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddb1Q3U1J4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms