Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hace1Q3U0D9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hace1Q3U0D9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hace1Q3U0D9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hace1Q3U0D9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms