Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccndbp1Q3TVC7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccndbp1Q3TVC7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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