Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc136Q3TVA9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc136Q3TVA9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ccdc136Q3TVA9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Ccdc136Q3TVA9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ccdc136Q3TVA9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms