Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tamm41Q3TUH1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tamm41Q3TUH1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms