Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf3c3Q3TMP1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c3Q3TMP1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c3Q3TMP1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms