Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp39Q3TIX9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp39Q3TIX9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp39Q3TIX9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms