Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cul4aQ3TCH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cul4aQ3TCH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms