Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms