Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccbe1Q3MI99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccbe1Q3MI99 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms