Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-M3Q31093 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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H2-M3Q31093 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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H2-M3Q31093 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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H2-M3Q31093 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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H2-M3Q31093 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-M3Q31093 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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