Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdgfl1Q2VPR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdgfl1Q2VPR5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdgfl1Q2VPR5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms