Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chrna5Q2MKA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna5Q2MKA5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chrna5Q2MKA5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrna5Q2MKA5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms