Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim71Q1PSW8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim71Q1PSW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms