Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd300lgQ1ERP8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd300lgQ1ERP8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300lgQ1ERP8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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