Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tdrd9Q14BI7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Tdrd9Q14BI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Tdrd9Q14BI7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tdrd9Q14BI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tdrd9Q14BI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms