Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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