Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q149G0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q149G0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q149G0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q149G0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q149G0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q149G0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q149G0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q149G0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q149G0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q149G0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q149G0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q149G0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q149G0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q149G0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q149G0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q149G0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q149G0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q149G0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q149G0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q149G0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q149G0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q149G0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q149G0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q149G0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q149G0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q149G0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q149G0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q149G0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q149G0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q149G0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q149G0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q149G0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q149G0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q149G0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms