Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col19a1Q0VF58 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col19a1Q0VF58 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col19a1Q0VF58 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col19a1Q0VF58 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms