Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem52bQ0VBF2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem52bQ0VBF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem52bQ0VBF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms