Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata18Q0P557 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spata18Q0P557 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata18Q0P557 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata18Q0P557 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms