Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cass4Q08EC4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cass4Q08EC4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cass4Q08EC4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms