Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc4Q08624 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc4Q08624 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms